清關不利表現在以下幾點:
(一)航班異常
在實際操作中，時常會出現航班異常的情況，即貨物不能準時到達口岸，這會在一定意義上影響口岸的清關時效。也有一些時候，在同一電商貨物較多的情況下，如果航空公司艙位配置不夠，則會導致貨物落貨現象，使貨物不能全部到達口岸。這時，因為貨物未到齊全，口岸也就不能進行相應清關手續(xù)的辦理。
(二)艙單問題
自2014年8月海關總署推出新艙單系統(tǒng)之后，各地紛紛響應新艙單申報系統(tǒng)。蕭山機場海關快件科要求，在辦理跨境時，必須先確定航空公司發(fā)送的原始艙單數據與機場進港部發(fā)送的理貨報告是否完全一致。如果不一致，海關系統(tǒng)將無法辦理業(yè)務。而在實際操作中，艙單問題是影響清關時效的最大問題。
(三)聯(lián)系不上收件人
有可能由于收件人資料不對或者放假等原因導致聯(lián)系不上收件人，無法確認清關信息或者關稅支付問題等，而影響清關手續(xù)的辦理。


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